Sinopsis

Usando el fósil del Pokémon Legendario Mew, el Team Rocket ha creado el primer clon de Pokémon exitoso. Nombrado Mewtwo, el Pokémon creado artificialmente se enfurece rápidamente por las circunstancias de su creación y desata su furia. Pronto es contactado por Sakaki, el líder del Team Rocket, y es manipulado para cometer actos malvados. Repulsado por las artimañas de la humanidad y las crueldades que ha sufrido, Mewtwo se aísla de todos y trama contra los humanos mientras intenta descubrir su verdadero propósito en la vida. Disfrazándose como el entrenador de Pokémon más fuerte del mundo, Mewtwo atrae a los entrenadores más poderosos de la región que desean enfrentarse al nuevo y misterioso oponente. Con el destino del mundo en juego, los renombrados entrenadores Satoshi, Takeshi y Kasumi deben luchar contra Mewtwo y derrotarlo antes de que traiga la caída de la humanidad.