Tras el torneo de la Liga Isshu Higaki, Satoshi y sus amigos emprenden un nuevo viaje hacia las "Ruinas Blancas" descubiertas por el padre del Profesor Araragi, un lugar conectado con Reshiram, un Pokémon legendario. Allí conocen al misterioso joven N, quien afirma poder entender lo que dicen los Pokémon. ¡Y entonces el grupo se ve involucrado en un ominoso experimento sobre Pokémon llevado a cabo

Tras el torneo de la Liga Isshu Higaki, Satoshi y sus amigos emprenden un nuevo viaje hacia las "Ruinas Blancas" descubiertas por el padre del Profesor Araragi, un lugar conectado con Reshiram, un Pokémon legendario. Allí conocen al misterioso joven N, quien afirma poder entender lo que dicen los Pokémon. ¡Y entonces el grupo se ve involucrado en un ominoso experimento sobre Pokémon llevado a cabo por el Team Plasma! ¡Mediante las obras del misterioso científico Achroma, ¡incluso Pikachu y Kibago se vuelven hostiles hacia Satoshi y amigos!? ¿Cuáles son las verdaderas ambiciones del líder del Team Plasma, Ghetsis, quien revela que la pandilla ha estado buscando a N? ¡Y entonces, el trío del Team Rocket regresa a la Región Isshu! Su misión actual los pone en conflicto con el Team Plasma... ¡¿cómo resultará la batalla resultante?!