Sinopsis

Tras el fallido intento de NERV por recuperar las Lanzas de Longinus y llevar a cabo el Proyecto de la Instrumentalidad Humana, la destrucción causada por el Cuarto Impacto ha sido en gran parte evitada. En un estado de desorden, Shinji Ikari, Asuka Langley Shikinami y Rei Ayanami viajan a la Aldea 3, un asentamiento de supervivientes libre de la ruina de la Tierra. Allí, Shinji poco a poco va aceptando su pasado, desarrollando una vida completamente diferente a sus días como piloto de Evangelion. Mientras tanto, NERV se prepara para continuar el Proyecto de la Instrumentalidad por medio de un nuevo Impacto. Cuando el principal acorazado aéreo de WILLE llega a la aldea, Shinji decide abordar, creyendo que puede ayudar pilotando un Evangelion. A medida que se descubren nuevos secretos y se acerca una batalla entre WILLE y NERV, el futuro de la Tierra pende de un hilo. ¿Podrá Shinji salvar a la humanidad y al resto del mundo una última vez? [Escrito por MAL Rewrite]