Sinopsis

Catorce años después del Tercer Impacto, la Tierra es un páramo postapocalíptico, la civilización humana está en ruinas, y las personas que Shinji Ikari conoce son casi irreconocibles. Atrapado dentro del Evangelion Unidad-01, es recuperado del espacio por Asuka Langley Shikinami y Mari Illustrious Makinami, solo para encontrarse prisionero de WILLE, una facción militar liderada por su antigua tutora, Misato Katsuragi. Fríos y amargados, sus antiguos aliados lo ven con sospecha y se niegan a apoyarlo mientras él asimila las consecuencias de sus acciones. Un Shinji herido y confundido es rescatado de WILLE por Rei Ayanami y devuelto al cuartel general de NERV. Allí, conoce y rápidamente se hace amigo del enigmático Kaworu Nagisa, quien le ofrece calidez y una visión sobre el estado de la guerra de NERV contra los Ángeles. Pero el breve respiro de Shinji y Kaworu se encuentra en la víspera de una nueva batalla, una en la que Shinji descubre que sus enemigos ya no son los Ángeles, sino antiguos camaradas. En esta amarga confrontación para determinar el futuro del mundo, Shinji aprenderá de primera mano que el pasado realmente no puede deshacerse.