El año es 1999. Amamori Hajime es solo un estudiante de primaria normal y corriente, que intenta estudiar y pasar el rato con sus locos amigos. Pero un día, mientras su padre prueba un equipo en el que ha estado trabajando, algo hace que explote, ¡llevándose la casa con él! Ahora huérfano, Hajime es acogido por su tío, un astrónomo. Allí, en el observatorio de su tío, conoce a una chica que ha vis

El año es 1999. Amamori Hajime es solo un estudiante de primaria normal y corriente, que intenta estudiar y pasar el rato con sus locos amigos. Pero un día, mientras su padre prueba un equipo en el que ha estado trabajando, algo hace que explote, ¡llevándose la casa con él! Ahora huérfano, Hajime es acogido por su tío, un astrónomo. Allí, en el observatorio de su tío, conoce a una chica que ha visto antes y por la que ha desarrollado cierto enamoramiento. Descubre que su nombre es Yukino Yayoi, y que sus padres tienen una tienda de ramen en la ciudad. ¡Pero aún mejor que eso, ella es la asistente de su tío! ¡Qué suerte! Pero Yayoi no es exactamente lo que parece. Hay una razón por la que ayuda a Amamori-san en el observatorio. Ella es la Reina Milenaria (Sen-Nen Joou), elegida especialmente por su planeta natal, LaMetal, para ir a la Tierra y ayudar a prepararse para la posible aniquilación del planeta. ¿Qué causará este desastre? LaMetal tiene una órbita extremadamente elíptica, que la envía muy, muy cerca de la Tierra cada 1000 años. Cuando se acerca lo suficiente, la Tierra reacciona, causando todo tipo de desastres naturales. Aunque fue elegida pensando en proteger LaMetal, su plan personal es evacuar a tantos humanos como pueda a LaMetal, para que si su planeta es destruido, ellos sobrevivan. Sin embargo, hay una persona que se esfuerza por detener su plan, el jefe de los Ladrones Milenarios. ¿Por qué quiere detener a Yayoi? ¿Y cómo sabe de la Reina Milenaria, de todos modos?