El acorazado Aegis Destroyer realiza ejercicios públicos en la Bahía de Maizuru, donde, coincidentemente, recientemente se avistó un barco extranjero sospechoso. Conan Edogawa, Ran Mouri, Kogorou Mouri, Sonoko Suzuki y los Detective Boys reciben una invitación para asistir a este evento. Sin embargo, mientras se desarrollan las operaciones militares, uno de los miembros de la tripulación encuentra

El acorazado Aegis Destroyer realiza ejercicios públicos en la Bahía de Maizuru, donde, coincidentemente, recientemente se avistó un barco extranjero sospechoso. Conan Edogawa, Ran Mouri, Kogorou Mouri, Sonoko Suzuki y los Detective Boys reciben una invitación para asistir a este evento. Sin embargo, mientras se desarrollan las operaciones militares, uno de los miembros de la tripulación encuentra un brazo izquierdo cercenado de un teniente. Conan descubre más tarde que un espía extranjero podría haberse infiltrado en el acorazado para obtener información clasificada por cualquier medio necesario. Si la información se filtrara, la línea de defensa de Japón quedaría expuesta, dejando al país desprotegido de un ataque hostil. Con la ayuda de la policía en el mar, mientras otros amigos y aliados investigan en tierra firme, Conan debe ahora prevenir esta crisis nacional e identificar al espía por el bien de Japón.