Después de que un horrible experimento de alquimia sale mal en la casa de los Elric, los hermanos Edward y Alphonse se encuentran en una nueva y catastrófica realidad. Ignorando el principio alquímico que prohíbe la transmutación humana, los chicos intentaron traer de vuelta a la vida a su madre recién fallecida. En cambio, sufrieron una brutal pérdida personal: el cuerpo de Alphonse se desintegró

Después de que un horrible experimento de alquimia sale mal en la casa de los Elric, los hermanos Edward y Alphonse se encuentran en una nueva y catastrófica realidad. Ignorando el principio alquímico que prohíbe la transmutación humana, los chicos intentaron traer de vuelta a la vida a su madre recién fallecida. En cambio, sufrieron una brutal pérdida personal: el cuerpo de Alphonse se desintegró mientras que Edward perdió una pierna y luego sacrificó un brazo para mantener el alma de Alphonse en el plano físico, uniéndola a una imponente armadura. Los hermanos son rescatados por su vecina Pinako Rockbell y su nieta Winry. Conocida como una prodigio de la ingeniería biomecánica, Winry crea extremidades protésicas para Edward utilizando "automail", un metal resistente y versátil usado en robots y armaduras de combate. Después de años de entrenamiento, los hermanos Elric se embarcan en una misión para restaurar sus cuerpos localizando la Piedra Filosofal, una gema poderosa que permite a un alquimista desafiar las leyes tradicionales del Intercambio Equivalente. Mientras Edward se convierte en un alquimista infame y gana el apodo de "Fullmetal", el viaje de los chicos los enreda en una creciente conspiración que amenaza el destino del mundo.