En el año A.G. 101 (el año 101 del calendario de la Generación Avanzada), una misteriosa entidad conocida solo como "UE", o "enemigo desconocido", ataca y destruye la colonia espacial Angel. Este brutal ataque se vuelve infame como "El día que el Ángel cayó", y marca el comienzo de la guerra de la humanidad por su supervivencia. La serie comienza en el año A.G. 108, cuando la UE ataca la colonia

En el año A.G. 101 (el año 101 del calendario de la Generación Avanzada), una misteriosa entidad conocida solo como "UE", o "enemigo desconocido", ataca y destruye la colonia espacial Angel. Este brutal ataque se vuelve infame como "El día que el Ángel cayó", y marca el comienzo de la guerra de la humanidad por su supervivencia. La serie comienza en el año A.G. 108, cuando la UE ataca la colonia espacial Ovan, donde Flit Asuno vive con su madre. La madre de Flit es asesinada por la UE, y entre sus pertenencias (en un objeto llamado "Dispositivo AGE") él descubre los planos de un arma poderosa del pasado: el antiguo mesías llamado "Gundam". A partir de estos planos, Flit pasa los siguientes años estudiando ingeniería en una base de la Federación Terrestre en la colonia espacial Nora y diseñando el Gundam AGE-1. Siete años después, en el año A.G. 115, Flit completa el Gundam, justo cuando la UE ataca Nora. La batalla de Flit y su linaje pilotando el AGE-1 para proteger a la humanidad está a punto de comenzar.