Un día, el brillante sol rojo dejó de brillar, causando el "Fenómeno de Colapso", la destrucción del pueblo de Arata Kasuga y la desaparición de sus habitantes. Sin embargo, no todo está perdido; al utilizar el grimorio mágico que le dio su amiga de la infancia y prima, Hijiri Kasuga, el mundo de Arata es reconstruido artificialmente. Para investigar el fenómeno, Lilith Asami aparece ante Arata,

Un día, el brillante sol rojo dejó de brillar, causando el "Fenómeno de Colapso", la destrucción del pueblo de Arata Kasuga y la desaparición de sus habitantes. Sin embargo, no todo está perdido; al utilizar el grimorio mágico que le dio su amiga de la infancia y prima, Hijiri Kasuga, el mundo de Arata es reconstruido artificialmente. Para investigar el fenómeno, Lilith Asami aparece ante Arata, cuyo mundo artificial se desintegra repentinamente. Se le dan dos opciones: entregar el libro o morir. Sin embargo, Arata elige una tercera opción: inscribirse en la escuela de magia de alto secreto, Royal Biblia Academy, donde lo esperan otros seis usuarios de magia. Junto a Lilith, estos seis forman el Trinity Seven, la élite de la escuela que cada uno potencia su propio poder y habilidad. Con la ambición de salvar a Hijiri y la ayuda de sus nuevos amigos, Arata no se detiene ante nada para evitar la destrucción de su amado pueblo natal y traer de vuelta a su mejor amiga.