Han pasado dos años desde la incursión del CCG en Anteiku. Aunque la atmósfera en Tokio ha cambiado drásticamente debido a la creciente influencia del CCG, los ghouls continúan representando un problema, ya que han empezado a ser más cautelosos, especialmente la organización terrorista Aogiri Tree, que reconoce la creciente amenaza del CCG para su existencia. La creación de un equipo especial, co

Han pasado dos años desde la incursión del CCG en Anteiku. Aunque la atmósfera en Tokio ha cambiado drásticamente debido a la creciente influencia del CCG, los ghouls continúan representando un problema, ya que han empezado a ser más cautelosos, especialmente la organización terrorista Aogiri Tree, que reconoce la creciente amenaza del CCG para su existencia. La creación de un equipo especial, conocido como el Escuadrón Quinx, podría proporcionar al CCG el impulso que necesita para exterminar a los residentes indeseados de Tokio. Al ser humanos que han sido sometidos a cirugía para poder utilizar las habilidades especiales de los ghouls, participan en operaciones para erradicar a estas peligrosas criaturas. El líder de este grupo, Haise Sasaki, es un semi-ghoul, semi-humano que ha sido entrenado por el famoso investigador de clase especial, Kishou Arima. Sin embargo, hay más en este joven de lo que parece, ya que recuerdos desconocidos arañan su mente, recordándole lentamente quién solía ser.