Año 2089 – Han pasado 80 años desde que la Guerra Espacial I cambió las vidas de las razas humana y Zentradi. Ambas razas viven en paz en la Tierra cuando una nueva raza alienígena llamada los "Marduk" aparece en el Sistema Solar. Mientras cubre la primera batalla entre la U.N. Spacy y la flota Marduk, el reportero novato de SNN, Hibiki Kanzaki, descubre a Ishtar, una "Emuladora" que mejora las ha

Año 2089 – Han pasado 80 años desde que la Guerra Espacial I cambió las vidas de las razas humana y Zentradi. Ambas razas viven en paz en la Tierra cuando una nueva raza alienígena llamada los "Marduk" aparece en el Sistema Solar. Mientras cubre la primera batalla entre la U.N. Spacy y la flota Marduk, el reportero novato de SNN, Hibiki Kanzaki, descubre a Ishtar, una "Emuladora" que mejora las habilidades de combate de los Marduk a través del canto. Hibiki lleva a Ishtar a la Tierra para enseñarle los valores de la vida y la cultura. Junto con la piloto as de Valkyrie, Silvie Gena, Hibiki e Ishtar deben encontrar una manera de salvar la Tierra de la destrucción total a manos del líder Marduk, Ingues.