Todos los días, Aya Asagiri piensa en suicidarse. Es acosada sin piedad en la escuela y en casa, su hermano mayor Kaname la maltrata físicamente para aliviar el estrés académico que su padre le impone. Una noche, mientras yace despierta deseando la muerte, un misterioso sitio web llamado Magical Girl Site aparece en su laptop, prometiendo darle poderes mágicos. Al principio, lo descarta como una

Todos los días, Aya Asagiri piensa en suicidarse. Es acosada sin piedad en la escuela y en casa, su hermano mayor Kaname la maltrata físicamente para aliviar el estrés académico que su padre le impone. Una noche, mientras yace despierta deseando la muerte, un misterioso sitio web llamado Magical Girl Site aparece en su laptop, prometiendo darle poderes mágicos. Al principio, lo descarta como una broma espeluznante, pero cuando encuentra una pistola mágica en su casillero al día siguiente, no sabe qué creer. Decidiendo llevarla consigo, pronto se encuentra de nuevo con sus acosadores. Pero esta vez, desesperada por cualquier cosa que la salve, usa la pistola y sus agresores son transportados a un cruce de ferrocarril cercano, donde son arrollados. La conciencia de Aya no puede soportar el hecho de que asesinó a dos de sus compañeras de clase con magia, y trata desesperadamente de entender la situación. Sin embargo, cuando se ve en problemas de nuevo, es salvada por Tsuyuno Yatsumura, una compañera de clase que puede usar magia para detener el tiempo. Este dúo tiene mucho que hacer: no solo deben luchar junto y contra otras chicas mágicas, sino que también necesitan descubrir la verdad detrás del sitio web y el evento apocalíptico conocido como "The Tempest" que pronto ocurrirá.