Las distinguidas magas Nanoha Takamachi, Fate Testarossa y Hayate Yagami ahora trabajan como personal militar para la Buró de Administración de Tiempo y Espacio en el planeta Midchilda, habiendo completado sus estudios en la Tierra en los últimos diez años desde el incidente del "Libro de la Oscuridad". Un día, las tres terminan ayudando al Buró a responder a un grave incendio en el aeropuerto, p

Las distinguidas magas Nanoha Takamachi, Fate Testarossa y Hayate Yagami ahora trabajan como personal militar para la Buró de Administración de Tiempo y Espacio en el planeta Midchilda, habiendo completado sus estudios en la Tierra en los últimos diez años desde el incidente del "Libro de la Oscuridad". Un día, las tres terminan ayudando al Buró a responder a un grave incendio en el aeropuerto, pero sus esfuerzos no son reconocidos. Una serie de desafortunados eventos motivan a Hayate a crear la unidad de élite Riot Force 6, la cual se encarga de casos que involucran la seguridad pública, así como peligrosos objetos mágicos conocidos como Lost Logia. Allí, el trío trabaja junto a aspirantes reclutas, Subaru Nakajima, Teana Lanster, Caro Ru Lushe y Erio Mondial, quienes soportan un difícil entrenamiento para cumplir las expectativas mientras superan obstáculos y logran metas personales. Sin embargo, llevar a cabo su misión demuestra ser una lucha constante. Luchando contra enemigos que explotan los Lost Logia y enfrentando críticas desde dentro del Buró, Riot Force 6 rápidamente se ve sobrecargada.