Sinopsis

En Nochebuena, Hana, Gin y Miyuki rebuscan entre montones de basura en busca de regalos cuando se topan con un bebé abandonado en la fría noche invernal. Horrorizada por la penosa escena, el instinto maternal de Hana se activa e insiste en encontrar a la madre biológica del bebé para exigir una explicación. Llamando al bebé Kiyoko —que significa "niño puro"—, comienzan su búsqueda utilizando las posibles pistas dejadas junto a ella: una llave misteriosa y una sola nota. Sin embargo, sus planes pronto se ven sumidos en el caos al verse atrapados en una serie de eventos sin precedentes. Tokyo Godfathers sigue el viaje del trío mientras se mantienen unidos en las buenas y en las malas, esperando entregar a Kiyoko a su verdadero hogar y encontrar su propio milagro navideño.