El Mundo Azul, que simboliza la razón, está bajo constante ataque de las criaturas llamadas Nightfly O'Note, originarias del Mundo Rojo, que simboliza el instinto. Akira Asagi, la protagonista de 17 años que es investigadora en el Mundo Azul, es nominada para liderar la guerra en Ryuukyuu LAG, una orgullosa instalación de defensa en las islas de Ishigaki e Iriomote. Allí conoce a la sexta unidad d

El Mundo Azul, que simboliza la razón, está bajo constante ataque de las criaturas llamadas Nightfly O'Note, originarias del Mundo Rojo, que simboliza el instinto. Akira Asagi, la protagonista de 17 años que es investigadora en el Mundo Azul, es nominada para liderar la guerra en Ryuukyuu LAG, una orgullosa instalación de defensa en las islas de Ishigaki e Iriomote. Allí conoce a la sexta unidad de combate "IS", formada cuatro años después de una feroz batalla que aniquiló a la quinta unidad. Akari debe liderar a estos seis jinetes, también llamados Scared Rider Xechs, para luchar contra el otro mundo, mientras al mismo tiempo profundiza la relación entre ellos.