Sinopsis

Un día, mientras Remu Mikage está en una videollamada con su hermana, Shiki, quien ha viajado a la futurista Ciudad Mega Float de la isla Okinotori para asistir a la escuela, ella confiesa que tanto el audio como la imagen son completamente artificiales. Para ser más eficiente en sus estudios, Shiki ha utilizado nanobots conectados neuralmente para subir su consciencia a una computadora y está almacenando su cuerpo físico en una "piscina de cuerpos". Aunque sorprendido, Remu apoya la decisión de su hermana, hasta que ocurre el desastre conocido como el "Rapture Temprano". El Rapture Temprano causa que todas las personas que han subido su consciencia caigan en coma o perezcan. Remu visita el apartamento vacío de su hermana por última vez, pero se sorprende cuando Shiki aparece en la puerta. Sin recuerdos de su familia o pasado, y siendo perseguida por un violento grupo de investigadores, Shiki y su hermano se ven forzados a huir usando su recién descubierto poder de manipulación de nanobots.